27 июня в Черноморском филиале Московского Государственного Университета имени М.В. Ломоносова состоялся 10-й выпуск студентов. Торжества прошли в большом зале Русского драматического театра им. Б. Лавренева, котором приняли участие руководство филиала, преподаватели, представители ЧФ РФ, родители выпускников. В мероприятиях приняли участие: помощник благочинного Севастопольского округа иерей Алексий Петренко и настоятель Свято-Никольского храма-памятника протоиерей Георгий Поляков. В своем выступлении отец Алексий от имени Севастопольского благочиния поздравил студентов с успешным окончанием учебы и пожелал им успехов.
Черноморский филиал Московского государственного университета им. М. В. Ломоносова был создан 29 марта 1999 года по инициативе мэра Москвы Ю.М. Лужкова и ректора МГУ В.А. Садовничего на основании Решения Ученого Совета МГУ. Это решение было согласовано с правительствами России и Украины. Огромную поддержку в создании филиала (как организационную, так и финансовую) оказало правительство г. Москвы. Еще 5 февраля 1999 года мэр Москвы Ю.М. Лужков издал Распоряжение "О вопросах создания Черноморского филиала МГУ им. М.В. Ломоносова". С тех пор и по сей день Московское правительство играет решающую роль в создании и приумножении материальной базы филиала. Практическую реализацию проектов строительства учебного и лабораторного корпусов, общежитий, столовой, Дома культуры и спорткомплекса осуществляет строительное управление Черноморского флота России. В соответствии с постановлением Правительства Российской Федерации от 28 марта 2008 года № 223 и приказа ректора МГУ имени М.В. Ломоносова № 418 от 03 июня 2008 года, Черноморский филиал МГУ им. М.В. Ломоносова стал иметь полное официальное наименование - Филиал Московского государственного университета имени М.В. Ломоносова в городе Севастополе. Филиал МГУ создавался для дальнейшего улучшения российско-украинских отношений, восстановления единого культурного и информационного пространства Содружества независимых государств. Концепцией создания Филиала МГУ предусмотрено, что обучаться в нем на равных условиях могут граждане России, Украины и любого другого государства мира. Но в первую очередь он создавался, чтобы российские соотечественники, проживающие в Севастополе, Крыму и Украине могли, не выезжая за границу, получать высшее образование в лучшем и старейшем вузе России. В 1999-2003 годах организацией работы Филиала руководил его первый директор Владимир Алексеевич Трифонов. В 2004-2005 годах Филиал МГУ возглавлял профессор Анатолий Владимирович Кезин. С 2005 года директором филиала вновь был назначен В.А. Трифонов. В июле 1999 года состоялся первый набор студентов, хотя реконструкция учебного корпуса Филиала еще продолжалась. Поэтому, вступительные экзамены проводились в средней школе № 8 Министерства обороны России в г. Севастополе, а учиться 100 прошедших испытания первокурсников отправились в Москву. 1 сентября 2000 года реконструированное здание Главного корпуса Филиала МГУ открыло свои двери для 120 первокурсников и вернувшихся из Москвы студентов первого набора. С этого дня Филиал стал неотъемлемой частью образовательного и научного пространства Севастополя.